Ưu đãi theo ngành nghề/địa bàn khuyến khích đầu tư là loại bị bỏ lỡ nhiều nhất.
Ưu đãi bị bỏ lỡ phổ biến nhất là ưu đãi thuế suất/miễn giảm theo ngành nghề, địa bàn khuyến khích đầu tư và ưu đãi cho doanh nghiệp mới thành lập trong những năm đầu — nhiều SME đủ điều kiện nhưng không đăng ký hoặc không lưu đủ hồ sơ chứng minh nên tự đánh mất quyền hưởng ưu đãi.
Nhiều doanh nghiệp đủ điều kiện nhưng không biết ngành mình thuộc diện ưu đãi.
Đăng ký muộn có thể khiến doanh nghiệp mất quyền hưởng ưu đãi cho cả giai đoạn đã qua.
Thiếu hồ sơ khi thanh tra khiến ưu đãi đã hưởng bị truy thu kèm phạt chậm nộp.
Chính sách ưu đãi thuế thay đổi thường xuyên, doanh nghiệp không cập nhật dễ áp dụng sai.